Жители посёлка Крестцы считают, что плотина Ямской ГЭС каждую весну становится одной из причин паводковых подтоплений. В единой диспетчерской службе Крестецкого района говорят, что плотина не препятствует проходу воды и не влияет на паводок. 20 апреля 2018 года разница в уровне воды до и после плотины составляла 1.2 метра.