Действие Metro: Last Light происходит в 2034 году, через год после событий Metro 2033, где Артём совершил ракетный удар по Чёрным — таинственным существам, якобы угрожавшим выжившим в московском метрополитене после ядерной войны. Орден «Спарта» — нейтральная миротворческая сила, с тех пор заняла военный объект Д6, который Артём посетил ещё в предыдущей игре. Д6 — огромный и ещё не до конца исследованный бункер. Ставший спартанцем в предыдущей части главный герой остаётся неуверенным и задаётся вопросом, было ли правильным решением убивать Чёрных. Слухи об открытии Д6 и его богатств распространились по всему метрополитену; соперничающие со спартанцами группировки коммунистическая Красная линия и фашистский Четвёртый рейх надеются захватить бункер и его содержимое.